Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ephb3P54754 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ephb3P54754 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms