Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Faf1P54731 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Faf1P54731 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms