Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad23aP54726 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rad23aP54726 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms