Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cacnb3P54285 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cacnb3P54285 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms