Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DbtP53395 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DbtP53395 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DbtP53395 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DbtP53395 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DbtP53395 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DbtP53395 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DbtP53395 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbtP53395 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbtP53395 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbtP53395 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbtP53395 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbtP53395 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbtP53395 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbtP53395 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbtP53395 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbtP53395 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DbtP53395 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms