Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2e3P52483 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2e3P52483 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms