Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp10P52479 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp10P52479 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms