Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Opn1swP51491 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn1swP51491 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms