Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RorcP51450 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RorcP51450 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RorcP51450 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RorcP51450 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms