Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RoraP51448 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RoraP51448 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RoraP51448 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RoraP51448 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RoraP51448 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RoraP51448 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RoraP51448 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms