Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LtbrP50284 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LtbrP50284 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LtbrP50284 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms