Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cxcl5P50228 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cxcl5P50228 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cxcl5P50228 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cxcl5P50228 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cxcl5P50228 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cxcl5P50228 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cxcl5P50228 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl5P50228 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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