Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Tmod1P49813 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Tmod1P49813 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Tmod1P49813 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Tmod1P49813 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Tmod1P49813 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Tmod1P49813 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Tmod1P49813 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Tmod1P49813 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Tmod1P49813 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Tmod1P49813 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmod1P49813 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmod1P49813 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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