Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ercc3P49135 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ercc3P49135 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms