Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ptx3P48759 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptx3P48759 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms