Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GdnfP48540 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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GdnfP48540 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GdnfP48540 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GdnfP48540 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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GdnfP48540 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GdnfP48540 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GdnfP48540 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GdnfP48540 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GdnfP48540 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GdnfP48540 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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GdnfP48540 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GdnfP48540 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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