Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfx2P48379 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rfx2P48379 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms