Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrprbP47758 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SrprbP47758 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms