Protein–RNA interactions for Protein: P47746

Cnr1, Cannabinoid receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnr1P47746 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnr1P47746 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnr1P47746 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms