Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zic1P46684 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zic1P46684 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms