Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sipa1P46062 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms