Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkx1-2P42580 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkx1-2P42580 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms