Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfsf9P41274 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms