Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbP41155 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbP41155 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbP41155 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbP41155 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbP41155 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbP41155 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbP41155 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbP41155 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbP41155 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbP41155 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtbP41155 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtbP41155 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtbP41155 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtbP41155 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtbP41155 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtbP41155 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LtbP41155 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LtbP41155 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LtbP41155 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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