Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TfamP40630 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TfamP40630 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TfamP40630 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TfamP40630 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TfamP40630 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TfamP40630 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TfamP40630 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TfamP40630 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TfamP40630 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TfamP40630 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TfamP40630 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms