Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Csf3rP40223 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Csf3rP40223 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms