Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf2P39429 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Traf2P39429 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Traf2P39429 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Traf2P39429 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms