Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Col18a1P39061 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col18a1P39061 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms