Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtlP38585 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtlP38585 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtlP38585 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtlP38585 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TtlP38585 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TtlP38585 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TtlP38585 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TtlP38585 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TtlP38585 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms