Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Upk2P38575 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Upk2P38575 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Upk2P38575 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Upk2P38575 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Upk2P38575 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Upk2P38575 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Upk2P38575 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Upk2P38575 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Upk2P38575 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms