Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lig1P37913 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms