Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddit3P35639 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddit3P35639 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms