Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6fP35460 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ly6fP35460 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms