Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ly6dP35459 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ly6dP35459 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms