Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sftpa1P35242 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sftpa1P35242 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms