Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ifnar1P33896 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifnar1P33896 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms