Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rom1P32958 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rom1P32958 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rom1P32958 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rom1P32958 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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