Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tacr1P30548 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tacr1P30548 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms