Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RxrgP28705 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxrgP28705 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RxrgP28705 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RxrgP28705 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms