Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RxraP28700 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RxraP28700 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxraP28700 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxraP28700 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxraP28700 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxraP28700 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RxraP28700 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxraP28700 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxraP28700 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxraP28700 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms