Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd9P28357 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd9P28357 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms