Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vav1P27870 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms