Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afxP27661 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afxP27661 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms