Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CftrP26361 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CftrP26361 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CftrP26361 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CftrP26361 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CftrP26361 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CftrP26361 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CftrP26361 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CftrP26361 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CftrP26361 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CftrP26361 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CftrP26361 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CftrP26361 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CftrP26361 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CftrP26361 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CftrP26361 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CftrP26361 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CftrP26361 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CftrP26361 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CftrP26361 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CftrP26361 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CftrP26361 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CftrP26361 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CftrP26361 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CftrP26361 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CftrP26361 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CftrP26361 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CftrP26361 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CftrP26361 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CftrP26361 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CftrP26361 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CftrP26361 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CftrP26361 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CftrP26361 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CftrP26361 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CftrP26361 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CftrP26361 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CftrP26361 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CftrP26361 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CftrP26361 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CftrP26361 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CftrP26361 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CftrP26361 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CftrP26361 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CftrP26361 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CftrP26361 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CftrP26361 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CftrP26361 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CftrP26361 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CftrP26361 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CftrP26361 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CftrP26361 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CftrP26361 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CftrP26361 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CftrP26361 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CftrP26361 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CftrP26361 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CftrP26361 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CftrP26361 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CftrP26361 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CftrP26361 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms