Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms