Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria1P23818 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gria1P23818 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms