Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Cxcl2-201ENSMUST00000075433 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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