Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsta3P23591 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsta3P23591 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms