Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Eif3aP23116 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eif3aP23116 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms