Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bmp4P21275 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bmp4P21275 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bmp4P21275 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bmp4P21275 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bmp4P21275 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bmp4P21275 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bmp4P21275 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bmp4P21275 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bmp4P21275 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms